第36集
孙家栋离开了研发岗位，为了不让孙家栋之前的心血白费，众人在陈希远的带领下，重新鼓足干劲。总装成功那天，孙家栋远远看了一眼这个七十二面的发光体，内心的激动难以抑制。卫星紧锣密鼓地进行技术测验，短波遥测系统却出现了严重的故障，钱学森提议把这个难题交给孙家栋来解决。孙家栋再次投入到卫星研发中，在没有计算机的条件下，他和高朝森花了整整一个晚上，找到了问题的关键。陈希远按照这个新方案，开展模拟实验。
第37集
二十世纪60年代，疟疾横行。越南社会主义共和国主席胡志明来到中国，希望中国政府帮助解决疟疾的防治问题。按照党中央的指示，中国人民解放军总后勤部商请国家科委，紧急启动代号为“523”的疟疾防治军工项目。屠呦呦被任命为中药所“523”课题组组长。随着小李和小梁两位组员的加入，中药所“523”课题组正式成立，他们的攻关目标是抑制抗疟药物头号种子常山碱的毒副作用。然而攻克常山碱毒性的研究进展并不乐观，屠呦呦提出更换思路，寻找其它有效的抗疟新药的想法。
第38集
课题组三人动身去海南岛做临床试验，屠呦呦发现虽然他们带来的药物对疟原虫有一定的抑制作用，但不能真正杀灭疟原虫。深夜，屠呦呦翻看着《疟疾单秘验方集》，发现许多民间验方都提到了青蒿，她认为这应该不是偶然的。屠呦呦和组员小纪被派往四川去做外调，屠呦呦想到青蒿是四川的方子，欣然同意。此时，屠呦呦的父母带着屠呦呦的小女儿李军来京探访屠呦呦，却恰逢家中无人。外调回来的屠呦呦，发现小李和小梁都被调离了523课题组。
第39集
屠呦呦翻看《肘后备急方》中“青蒿一握，以水二升渍，绞取汁，尽服之”的验方，若有所悟。回到家中，李廷钊为屠呦呦准备了一碗醪糟，告诉屠呦呦做醪糟的关键是温度，屠呦呦受到启发。屠呦呦利用乙醚为溶剂低温提取出的青蒿中性部分，鼠虐模型的疟原虫抑制率达到100%。她将此命名为醚中干，一个全新的抗疟药物出现了。课题组要搞实验，又要批量生产，人手不够，继而增加了小岳和屈光明两位组员。
第40集
为了开展药物的毒性实验，动物房进了一批实验狗，由于条件有限，都是老龄狗，且严重营养不良。某晚，实验狗突然死亡，两位老专家的病理报告认为青蒿提取物的毒性较大，权威教授金录奎以此为根据判断青蒿粗提物不安全，不能上临床。实验室里，众人十分沮丧，屠呦呦却对专家的结论持怀疑态度。小岳偷偷找了一位卫生部的病理学专家，得出了与两位老专家相反的结论，认为实验狗死于老年狗的常见病变，而非药物原因。
第三十六集
第三十七集
第三十八集
第三十九集
第四十集
